كجزء من مهمتها في توثيق وحفظ التراث الملموس، قامت مكتبة الإسكندرية مع مركز دراسات الإسكندرية وحضارة البحر المتوسط (Alex Med) ببناء نماذج للمباني المندثرة والمهددة. تم الحصول على البيانات المستخدمة في بناء هذه النماذج من عدد من المصادر، ومنها البقايا المعمارية والوثائق التاريخية.
فنار الإسكندرية
تم تشييد فنار الإسكندرية القديم في عهد بطليموس الثاني فيلادلفوس ما بين ٢٨٣ و٢٧٩ ق.م. وأقدم وصف معروف للفنار قام به المؤرخ والجغرافي الإغريقي سترابو الذي زار الإسكندرية في عام ٣٠ ق.م تقريبًا. في الأزمنة الحديثة، ساهم الوصف التفصيلي الذي قام به المعماري الألماني هيرمان تيرش في ١٩٠٦ لهذا الأثر في معرفتنا به. كما قام مركز دراسات الإسكندرية وحضارة البحر المتوسط (Alex Med) ببناء أربعة نماذج للفنار توضح مراحل تدهوره المختلفة.
البورصة
احتلت بورصة الإسكندرية الطرف الشرقي من ميدان القناصل (والذي عُرف فيما بعد بميدان محمد علي). إلا أنه في عام ١٩٧٧، احترق المبنى أثناء المظاهرات وتم هدمه نهائيًّا في ١٩٨٢.
أبو صير
أسس بطليموس الثاني فيلادلفوس مدينة أبو صير في حوالي٢٨٠ -٢٧٠ ق.م، على بعد ٤٥ كيلومترًا غرب الإسكندرية بمحاذاة الشاطئ الشمالي لبحيرة مريوط. كان المعبد الكبير في يومٍ ما مركز عبادة هامًّا للإلهين أوزوريس وإيزيس، وهو ما لم يتبق منه اليوم سوى الجدران الخارجية. ويقف في مقابل المعبد البرج الحجري الذي تم تشييده في العصر اليوناني الروماني والذي يُعرف اليوم ببرج العرب. ويُظن أن هذا البرج -وهو تقليد مصغر لفنار الإسكندرية- كان برج مراقبة أو فنارًا.
مسجد الألف عمود
من المعتقد أن بطليموس الثاني فيلادلفوس كان يحتل موقع هذا المسجد، حيث قامت فيه مجموعة من الباحثين اليهود بترجمة التوراة من العبرية إلى اليونانية. في حوالي ٢٨٢-٣٠٠ م، قام البابا ثاؤنا بتشييد كنيسة القديس سان أثناسيوس في هذا الموقع، والتي تحولت بعد ذلك إلى كنيسة مريم العذراء. وبحلول القرن السادس، تحولت الكنيسة إلى أطلال واستبدِل بها مسجد الألف عمود أثناء الفتح الإسلامي لمصر. قام عمرو بن العاص بتشييد هذا المسجد الذي يُعرف أيضًا باسم المسجد الغربي.
الإسكندرية القديمة
هذا النموذج الـمُصغر للإسكندرية القديمة مبني على خريطة عام ١٨٦٦ لمحمود الفلكي. تم تخطيط الشوارع في نمط شبكي. وكان الشارعان الرئيسيان هما شارع كانوبك (شارع فؤاد الآن) والذي يمتد من الشرق إلى الغرب وشارع سوما الممتد من الشمال إلى الجنوب. وتشمل عملية إعادة البناء أيضًا جزيرة فاروس وجسر الهيبتاستاديون المتصل بالبر الرئيسي. كما يظهر النموذج المباني العامة وأسوار المدينة القديمة والعربية.
صهريج سانت كاترين
بما أن الإسكندرية تفتقد موارد المياه العذبة، فقد تم بناء صهاريج تحت الأرض وكانت تُملأ سنويًّا بمياه الفيضان التي كان يتم توزيعها من خلال قنوات. ويعد صهريج سانت كاترين مثالاً على هذه الخزانات.
البيت الروماني
هو إعادة بناء لبيت روماني تقليدي من القرن الرابع بعد الميلاد. ويقع هذا البيت الموجود في كوم الدكة بالقرب من الأبنية العامة التي تتضمن مسرحًا رومانيًّا وحمامات وصهاريج ومدارس. ويتكون البيت -المصنوع من الحجر- من دورين بفناء في الوسط.
السرابيوم
شيد السرابيوم في عهد بطليموس الثالث (٢٤٦-٢٢١ ق.م) على هضبة خارج حدود المدينة البطلمية باتجاه الغرب، وتُعرف اليوم بكوم الشقافة. والنموذج الـمُصغر الخاص بمركز دراسات الإسكندرية وحضارة البحر المتوسط (Alex Med) هو إعادة بناء للسرابيوم الذي شيده الرومان. تضمن السرابيوم أيضًا ممرات تحت الأرض ومكتبة أخرى ملحقة بمكتبة الإسكندرية. واليوم، العنصر الوحيد الذي لايزال قائمًا هو عمود ديوكلتيانوس والمعروف باسم عمود السواري.