يعود إصدار المخطوطات الرقمية إلى رسالة المكتبة لاستخدام التقنيات الرقمية الحديثة. ويهدف مشروع مكتبة المخطوطات الرقمية إلى نشر ثروة مخطوطات التراث العربي في صورة رقمية. وقد شهد عام ٢٠٠٧ إصدار المجموعتين الخامسة والسادسة من مكتبة المخطوطات الرقمية، وتحديدًا دير سانت كاترين ومجموعة مكتبة السويد القومية. وتتكون كل مجموعة من سبع مخطوطات نادرة وكتيب تقديمي.