يسعى هذا المشروع الطموح إلى الحصول على أكبر عدد ممكن من النسخ الرقمية والميكروفيلم لمجموعات المخطوطات حول العالم، وذلك لتوفير مصادر البحث العلمي ودعم التعاون الأكاديمي ونشر التراث العلمي، وخصوصًا الأعمال المتعلقة بتاريخ العلوم وإسهامات الحضارة العربية الإسلامية للإنسانية. ويهدف المشروع الذي انطلق عام ٢٠٠٥ إلى الوصول إلى مائة ألف مخطوط. وقد تبادل مركز المخطوطات نسخًا من مخطوطات عربية مع معهد المخطوطات العربية بالقاهرة ومركز الجمعة المجيد للتراث والثقافة بالإمارات والمكتبة المركزية للمخطوطات الإسلامية في وزارة الأوقاف المصرية؛ مما أضاف خمسة آلاف ومائتين وثمانية وتسعين مخطوطًا لمجموعة المركز، محققًا أربعين في المائة من هدفه. وجميع المخطوطات متاحة للجمهور في قاعات اطلاع خاصة ،استضافت ألفًا وتسعمائة وخمسة وعشرين باحثًا من مختلف أنحاء العالم خلال عام واحد.