تقدم مكتبة الإسكندرية من بداية ٢٠٠٤، منحًا بحثيةً للباحثين المصريين تحت  سن ٣٥ سنةً، ممن حصلوا على درجة الدكتوراه خلال السنوات الخمس الماضية أو يتوقع حصولهم عليها خلال عام من إعلان المنحة. وتقدم منح مكتبة الإسكندرية البحثية فرصةً للعلماء المصريين لتطوير طريقهم المهني في أماكن عملهم من خلال تقديم العون المالي والسماح لهم بالمشاركة في ورش عمل ومحاضرات تتناول عددًا كبيرًا من المهارات الهامة لتطوير الطريق المهني، مع التركيز على البحث العلمي والتنمية. وتغطي المنحة البحث في كل مجالات العلوم الطبيعية والرياضيات وتكنولوجيا المعلومات. وقد تمت إضافة مجال جديد مؤخرًا؛ وهو التعليم ما قبل الجامعي. وتنوي مكتبة الإسكندرية أن تغطي المنح المزيد من المجالات البحثية؛ من أهمها العلوم الاجتماعية والإنسانيات. وعلى المتقدمين للمنح أن يكونوا من العاملين في معاهد بحثية أو أكاديمية مصرية (خاصة أو حكومية)، وأن يكونوا مشتغلين حاليًّا أو عازمين على العمل في مشروع بحثي مشترك مع شركاء أجانب من جامعة أو مركز أبحاث في الخارج. ومدة المشروع محدودة بعامين بحد أقصى، وأكبر منحة مقدمة هي ٧٥٠٠٠ جنيه مصري. وتتم كل خطوات التقديم للمنحة من خلال الموقع الإلكتروني، يعقبها عملية مراجعة للطلبات مُجَهلة الأسماء لتقييمها. وتتكون لجنة المراجعة حاليًّا من ٩٠ مراجِعًا من مختلف بلاد العالم ممثلين كل مجالات البحث العلمي. وقد قُبِلَ ٣١ باحثًا إلى الآن، وتسلموا المنح البحثية بالفعل.