يعد اكتشاف ثونيس – هيراكليون في مصب فرع نهر النيل في البحر الأبيض المتوسط مصدرًا للمعلومات التي فتحت مجالات بحثية جديدة؛ منها دور الموقع بين المجتمعات الساحلية الأصلية، وأنماط شَغْل المناطق الساحلية وإدارتها، وعلاقتها بتاريخ التجارة، وغيرها من المجالات البحثية. وتسمح تلك النظرة الشمولية، التي توضح أن المنطقة البحرية، وحوض نهر النيل، ومساحات الأراضي محطات سفر وترانزيت، بالإلمام بتفاصيل الموقع الكاملة من جوانبه التكنولوجية والاقتصادية. فدور ثونيس – هيراكليون كمحطة جمركية، وتنظيم المقايضات، والسياسات المعقدة هو ما جعل مصر تحتك ببلاد البحر المتوسط الأخرى.

بورتوس ماغنوس الإسكندرية
 

لقد جعلت الحملات الطوبوغرافية والاستطلاعية والحفائر الأثرية في الإسكندرية، وللمرة الأولى، تطوير بانوراما كاملة لبورتوس ماغنوس الشهير أمرًا ممكنًا، اعتمادًا على الملحوظات التي سُجلت في الموقع. فالطوبوغرافيا التي جُمِعَت مختلفة تمامًا عن تلك التي تُخُيلت من فهم النصوص. وبينما لم تعكس الاستكشافات الجيوفيزيائية لميناء الإسكندرية والحفائر التي تلتها روعة قصر الإسكندرية، إلا أنها ساعدت في عمل خريطة مفصلة للميناء الشرقي وما يحيط به. وقد أسفر البحث الدقيق عن الخطوط الخارجية، بل وأحيانًا هيكل المنشآت والمباني التي وُجدت من قبل بالقرب من القصر؛ مثل الموانئ الملكية، والتيمونيوم، وجزيرة أنتيرودس، وأرصفة الموانئ، وغيرها. فكانت ثورة في معرفتنا لطوبوغرافيا منشآت الميناء التي تخدم البازيليا؛ هذه المجموعة من القصور الساحلية على الضفة التي ضمَّت المباني الحكومية والمؤسسات الثقافية. فقد غيرت نتائج البحث معرفتنا بطوبوغرافيا الموانئ والقصور في الإسكندرية تغييرًا جذريًّا. وتتابعت دراسة أحواض رصيف الميناء؛ من أجل تحديد عمقها ونوع الترسيب فيها؛ حتى تتحدد أماكن الحطام، وتصميم أرصفة الموانئ. وقد صاحب تحديد العناصر المعمارية التي تغطي منطقة القصر ودراستها، استكشافات توضح تاريخ بناء المنشآت، وهجرها، وتدميرها. ولم يماثل تنظيم الموانئ تصورنا عنه؛ فهو متناسق أكثر من الناحية الفنية. فقد كان الميناء الشرقي خليجًا واسعًا، على حدوده أرصفة متعاقبة، بُنيت في العصر البطلمي، وحسَّنها الرومان لاحقًا (غرقت البنية التحتية للميناء في قاع البحر، أو بُني عليها سدود، وأرصفة، ومصارف منغلقة، وغيرها).