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Otra forma de prevenir la transmisión de VIH es proveyendo tratamiento antiretroviral a mujeres embarazadas para disminuir la transmisión madre-hijo. Este método de transmisión ha disminuído dramaticamente en países desarrollados. Al inicio de 1994, los resultados del Grupo de estudios clínicos sobre SIDA pediátrico (PACTG) 076 mostró una reducción del 66% en MTCT con el uso de zidovudine o AZT administrados a las 14 semanas de gestación y continuando por el resto del embarazo, durante el trabajo de parto por infusión endovenosa y al neonato por las primeras seis semanas de vida. Tasas de transmisión perinatal han disminuído en un 80% en los Estados Unidos. Este régimen, sin embargo, es demasiado costoso y complejo, para los lugares con recursos limitados.

Desde el estudio PACTG 076 hay algunos estudios clínicos de regímenes orales más cortos en poblaciones lactando y no lactando de recursos limitados y esos muestran una eficacia entre el 37 y 52% en reducción de MTCT. Lo más excitante de ellos y lo de más valor es el uso de una dosis única de nevirapine a la madre al inicio del trabajo de parto y una dosis única al neonato aen las primeras 48-72 horas de vida; esto fue conducido en una población lactando en Uganda y resultó en una reducción del 47% en la transmisión madre-hijo a los 4 meses de seguimiento, comparada a la zidovudine oral administrada a la madre durante el trabajo de parto y por una semana al recién nacido.